Virusul Marburg își ia numele din orașul omonim german, unde a apărut pentru prima dată în 1967, când a fost cauza a trei focare epidemice simultane în Germania (orașul Marburg și Frankfurt) și în fosta Iugoslavie (Belgrad). În ambele țări, virusul Marburg a fost probabil introdus cu importul de maimuțe verzi din Uganda ( Cercopithecus aethiops, cunoscut și ca Cercopiteco grigioverde).
Primele cazuri au fost înregistrate în rândul personalului unui laborator în contact strâns cu aceste primate. Cazurile secundare au implicat personalul spitalului în spitalele expuse materialelor biologice infectate.
Ulterior, au fost înregistrate episoade sporadice sau epidemii reale în Africa de Sud, Kenya, Republica Democratică Congo și Angola, pentru un total de aproximativ 600 de cazuri și 480 de decese.
