Encefalita japoneză este răspândită în aproape toată Asia și în unele regiuni din Oceania. Riscul de a dobândi infecția este, în general, limitat pentru majoritatea călătorilor, însă trebuie luată în considerare destinația, perioada de ședere și activitățile desfășurate în timpul șederii.
Zonele cu risc sunt în principal zonele rurale și agricole, în special cele destinate cultivării orezului, în care boala este endemică. Cu toate acestea, cazurile în sau în apropierea centrelor urbane nu sunt rare, dacă există condiții favorabile dezvoltării țânțarilor.
În Asia de Sud, riscul de îmbolnăvire prin mușcătura țânțarilor infectați este prezent pe tot parcursul anului, cu accente la ploile musonice până la începutul sezonului uscat; în regiunile temperate din China, Japonia și Peninsula Coreeană, pe de altă parte, transmisia este mai mare din mai până în septembrie (perioada de activitate cea mai mare a transportatorilor). Atunci când călătoriți în zone endemice, poate fi recomandată vaccinarea.
