Administrarea contraceptivei poate afecta valorile colesterolului din sânge. Greutatea acestui efect depinde de tipul de contraceptiv utilizat, mai ales de concentrația de estrogeni și progestogeni. Estrogele conținute în pastilele contraceptive par să crească ușor nivelurile de colesterol bun (HDL), în timp ce scăderea nivelului rău (LDL); rezultatul final este o ușoară creștere a colesterolului total, însoțită de o creștere semnificativă a trigliceridelor. Progesteronii conținute în pilulele contraceptive ar avea un efect contrar, având în vedere tendința de a crește colesterolul LDL prin scăderea cotei HDL.