Așa-numita floră intestinală putrefactivă are capacitatea de a digera proteine și peptide mici care au scăpat de digestie și absorbție enterică.
Putrezirea, fără surprindere, este procesul de descompunere a proteinelor. Faptul că o dietă bogată în proteine favorizează dezvoltarea unei flori bacteriene intestinale predominant putrefactive nu este accidentală.
Problemele derivă din faptul că, pornind de la proteine, aceste bacterii produc substanțe diferite (amine, amoniac, fenoli, indoli); printre care unele (în special aminele) conferă flatulenței un miros neplăcut (de exemplu, putrescină și cadaverină), în timp ce altele sunt deosebit de toxice sau chiar carcinogene.
Gândiți-vă doar la reacțiile de nitrozare din care pot genera compuși carcinogeni, cum ar fi nitroaminele. Acest lucru ar explica de ce o dieta bogata in carne si scazuta in fructe si legume este legata de un risc crescut de cancer colorectal.